密歇根理工大学初期以庞大的理工科招生规模以及出色的工程技术研究闻名。二战后，学校学科发展不断完善，逐渐形成了五个学院。1928年，美国空军在霍顿校区设置了美国空军预备军官训练团（ROTC），用以培养年轻军官。院系设置具体如下：

商业与经济学院（School of Business and Economics)

森林资源与环境学院（School of Forest Resources & Environmental Science)

工程学院（College of Engineering)，下辖8个系（Department)：

生物医学工程Biomedical Engineering

化学工程Chemical Engineering

土木与环境工程Civil and Engvironmental Engineering

电子电气工程Electrical and Computer Engineering

工程学Engineering Fundamentals

地质与采矿工程Geological/mining Engineering and Science

材料科学与工程Materials Science and Engineering

机械工程Mechanical Engineering

科学与艺术学院

生物学Biological Science

化学Chemistry

计算机技术Computer Science

认知学Cognitive and Learning Science

教育学Teacher Education

心理学Psychology

体育教育Exercise Science, Health and Physical Education

人类学Humanities

数学Mathematical Science

物理学Physics

社会学Social Science

科学与技术传媒Scientific and Technical Communication

视觉与表演学Visual and Performing Arts

美国空军训练团Air Force ROTC

军队教导团Army ROTC

技术学院（School of Technology)